宝可梦中心是玩家冒险过程中不可或缺的重要设施，几乎每座主要城市都设有该建筑。其标志性的红色屋顶和中央球形装置使其在城镇地图中极易辨认。宝可梦中心的主要功能是为玩家提供免费治疗服务，同时承担着通讯交换、任务触发等多项游戏机制的核心功能。
真新镇作为游戏起点，其宝可梦中心位于大木研究所附近，玩家在此首次接触治疗机器。常磐市的宝可梦中心紧邻道具商店，是早期剧情中获取大木包裹的关键地点。尼比市的宝可梦中心坐落在岩石道馆右侧，月见山探险前后建议在此恢复队伍状态。华蓝市的设施位于水系道馆对面，枯叶市的则毗邻港口与电系道馆，这些布局均经过精心设计以匹配玩家动线。
彩虹市的宝可梦中心规模最大，除基础治疗外还可进行特殊功能交互。紫苑镇的设施与宝可梦塔剧情紧密关联，浅红市的则靠近狩猎区入口。七之岛区域的宝可梦中心采用独立设计风格，尤其一之岛的设施承担着二周目剧情的重要节点功能。游戏后期，冠军之路前的宝可梦中心是挑战联盟前的最后补给站。
宝可梦中心的内部结构高度统一：左侧为治疗柜台，右侧是通讯交换区，二楼设有对战记录与教学功能。部分城市的二楼NPC会提供特殊道具或触发隐藏任务，例如枯叶市可获得战斗探测器。在游戏机制层面，这些设施通过定期存档、队伍恢复等设计有效降低了冒险难度，其分布密度与关卡难度曲线保持正相关。
探索过程中，建议优先解锁各城市的飞行点以提升移动效率。当队伍陷入异常状态或濒危时，系统会提示最近的治疗点位置。游戏内不存在需要付费使用的宝可梦中心，所有服务均为永久免费提供，这是区别于商业设施的核心特征。通过合理规划行进路线与治疗节点，能显著提升通关效率。
